Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms