Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms