Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms