Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms