Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP9Q5VTM2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP9Q5VTM2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms