Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms