Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms