Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CEP170Q5SW79 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms