Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms