Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XKR3Q5GH77 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms