Protein–RNA interactions for Protein: Q5EE01

CENPW, Centromere protein W, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPWQ5EE01 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPWQ5EE01 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPWQ5EE01 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPWQ5EE01 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPWQ5EE01 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms