Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms