Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms