Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFNL1Q499Z3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFNL1Q499Z3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms