Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms