Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS10Q3MIT2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUS10Q3MIT2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms