Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP41Q3LFD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP41Q3LFD5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms