Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD9Q3L8U1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD9Q3L8U1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
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