Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms