Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM183BQ1AE95 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM183BQ1AE95 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms