Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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