Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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