Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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