Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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