Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACKR1Q16570 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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