Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRNP35Q16560 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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