Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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PCSK7Q16549 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PCSK7Q16549 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PCSK7Q16549 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PCSK7Q16549 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PCSK7Q16549 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PCSK7Q16549 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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