Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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TNXAQ16473 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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