Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITSN1Q15811 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
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