Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIP4Q15650 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms