Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPAQ15257 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPAQ15257 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPAQ15257 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPAQ15257 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPAQ15257 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPAQ15257 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPAQ15257 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPAQ15257 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPAQ15257 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPAQ15257 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms