Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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