Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
R3HDM1Q15032 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms