Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPD2Q15021 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPD2Q15021 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPD2Q15021 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPD2Q15021 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPD2Q15021 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPD2Q15021 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPD2Q15021 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms