Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME4Q14997 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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