Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms