Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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IRF3Q14653 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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IRF3Q14653 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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IRF3Q14653 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF3Q14653 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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