Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN1Q14457 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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