Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EBI3Q14213 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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