Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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