Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPSQ13938 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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