Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms