Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX6Q13608 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX6Q13608 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX6Q13608 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX6Q13608 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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