Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC3Q13507 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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