Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTM1Q13496 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTM1Q13496 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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