Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATMQ13315 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATMQ13315 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATMQ13315 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATMQ13315 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms