Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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