Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms