Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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