Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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